データサイエンスと生命科学

医学・生命科学分野のデータ解析手法の研究と、数理・データサイエンス的なアプローチを用いた老化・寿命のメカニズム解明のための研究をしています。このブログでは、主に、データサイエンスや生命科学に関する解説記事などを発信します。

Latex備忘録

#UbuntuへのLatexのインストール方法

Ubutnu14.04 & Ubuntu16.04で実施

sudo apt-get install texlive
sudo apt-get install texlive-lang-cjk
sudo apt-get install texlive-fonts-recommended texlive-fonts-extra

 

#コマンドの使い方
platex sample.tex #コンパイル
dvipdfm sample.dvi #PDFとして出力

 

#Texworksのインストール
Texworksを入れると、GUIコンパイルなどができて便利
sudo apt-get install texworksで入れる

 

#学振Latex

学振Latexでは、更にpLatexを使えるようにする必要がある。

以下を参照

https://texwiki.texjp.org/?TeXworks%2F%E8%A8%AD%E5%AE%9A

 

 

画像ファイル備忘録

#マルチページtiffファイルの分割

マルチページtiffファイルを、それぞれjpgに分割したい場合がある。

この手順をいかに示す。

まず、UbuntuImagemagickをインストールする
sudo apt-get install ImageMagick
この結果、convertコマンドが使えるようになる。

次に、
convert file.tif file_%04d.jpg
を実行するとファイルがjpgに分割される。

Vim備忘録

#vim8のインストール
Ubuntu14.04およびUbuntu16.04にインストールした。コマンドは以下。
git clone https://github.com/vim/vim
cd vim
./configure \
sudo apt-get install ncurses-dev
make
sudo make intall

#vim8の設定
・ホームディテクトリにvimの追加の設定を書く。.vimrcという名前のファイルをおく。


#プラグイン管理ツールvim-plugのインストール

ここのサイトを参照。

https://raw.githubusercontent.com/junegunn/vim-plug/master/plug.vim

コマンドは以下。

/usr/bin/curl -fLo ~/.vim/autoload/plug.vim --create-dirs \

ここで、curlコマンドは他と衝突しないように絶対パスで指定した。

UbuntuでDropbox

Ubuntu16.04を使用。

 

#インストール

端末に「dropbox」と入力すると、doropboxをインストールするのに必要なコマンドが指示される。次に、指示されたコマンドを入力したらインストールできた。
sudo apt install nautilus-dropbox
dropbox start -i

インストール画面へ移行するので、各種設定・同期を行う。

Linuxコマンド備忘録

Ubuntu16.04を使ってます。

各種コマンドなどの備忘録(随時更新)

 

#コンピュータアーキテクチャの確認
uname -a

#パッケージの依存関係がおかしい時(何かが足りなくてインストールに失敗するとき)
sudo apt-get update
sudo apt-get -f install

Ubuntu16.04へのskypeのインストール

これで入った。

sudo apt-get install skypeforlinux

だた、一度シャットダウンすると起動できなくなるという症状が出た。

毎回シャットダウンするときに必ず、サインアウトするようにしたら改善した。